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RNA电泳操作步骤

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RNA电泳

试剂:

琼脂糖(Agarose)、甲醛、甲酰胺、MOPS、EDTA、DEPC水。

步骤

一 5 x MOPS-EDTA Buffer的配制(0.1 M MOPS pH7; 5mM EDTA; 10mM NaAc) 1. 称量20.9g的MOPS,置于1L烧杯中。 2. 加700mL DEPC水溶解。 3. 用2N NaOH调节pH至7.0

4. 在上述溶液中加入10mL的1M的NaAC 5. 溶液中加入10mL的0.5M的EDTA pH=8.0 6. 加DEPC水定容至1L

7. 用0.45um滤膜过滤后避光保存

二 RNA样品处理方法

RNA样品 甲醛 甲酰胺 5 x MOPS-EDTA Buffer 6 x Loading Buffer DEPC水 X uL 3.5 uL 4.0 uL 4uL 3.0 uL Up to 20 uL

混合均匀后,70°C加热5min,迅速冷却至室温。(PCR仪操作)

三 甲醛变性琼脂糖凝胶的制备 加1g琼脂糖到31mL DEPC水中,另加10mL 5 x MOPS-EDTA Buffer煮沸溶解。加入DEPC水定容至41mL。将溶液冷却至60°C左右,加入9mL 37%甲醛,倒入胶槽中静置1小时。(胶中加入EB染料) 四 电泳

混匀电泳槽中的1 x MOPS-EDTA Buffer电泳液,加样,10v/cm条件下电泳约1小时。电泳期间每隔15min混匀电泳槽中的电泳液一次。

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