法律分析：一、社保扣除底薪是否应该改变？
社保从底薪里扣是合理的。社保分企业部分和个人承担部分，如果是个人应该承担的部分，从工资扣是合理的。缴纳社会保险是是国家强制性的要求，国家文件里的都写得是缴纳，缴纳带有强制性的意思，和交纳含义是不一样的，如果不缴纳，会受到相应的处罚。
二、公积金缴存基数扣除了社保吗
公积金、社保缴纳基数可以不一样。公积金缴纳基数：各单位应按照统计局计算职工月平均工资的口径计算职工月平均工资，并以职工月平均工资作为该职工住房公积金缴存基数核定住房公积金月缴存额。各单位应在核定职工住房公积金月缴存额后一个月内，将核定情况告知职工本人，以维护职工的合法权益。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》
第四条中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。
第二条国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。
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